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更(gēng)新時(shí)間:2024-11-01
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一,tNGS技(jì)術(shù)原(yuán)理
tNGS是(shì)一種基於(yú)超多(duō)重PCR擴(kuò)增(zēng)(或(huò)靶向(xiàng)捕(bǔ)獲)與高通(tōng)量測序兩種技術(shù)結(jié)合的新一代測序(xù)技術(shù)。它使用大量(liáng)針對特(tè)定基(jī)因序列的(dí)引物(wù)/探針對待測(cè)樣品中(zhōng)抽提(tí)出的(dí)核(hé)酸進行超(chāo)多重PCR擴(kuò)增(zēng)/探針捕(bǔ)獲(huò),獲(huò)得(dé)大量目標核(hé)酸(suān)片段(duàn),再對(duì)這些(xiē)目標(biāo)核(hé)酸片(piàn)段進行高通(tōng)量測序(xù),然(rán)後對所得(dé)序(xù)列進(jìn)行生(shēng)物信(xìn)息學(xué)分析,從而實現(xiàn)對(duì)待測(cè)樣本中的核酸進行高(gāo)靈(líng)敏以及高分(fēn)辨(biàn)率的識別。
二,tNGS優(yōu)點(diǎn)
1. 針對性強:tNGS隻針(zhēn)對特定基因(yīn)序(xù)列進行測(cè)序(xù),因此(cǐ)可以(yǐ)大大減少(shǎo)測(cè)序(xù)數據量(liáng),提高檢測效率(shuài)和準確性。
2. 高(gāo)靈(líng)敏度(dù):由於tNGS可以對(duì)低(dī)濃度的病(bìng)原微生(shēng)物進行檢測,因此(cǐ)具有高(gāo)靈敏(mǐn)度(dù)。
3. 高分(fēn)辨(biàn)率:tNGS能(néng)夠實現對(duì)病原體(tǐ)特(tè)定基(jī)因(yīn)的高(gāo)分辨(biàn)率識別(bié),有助於(yú)精(jīng)準診(zhěn)斷(duàn)。
4. 成(chéng)本低:與mNGS相比(bǐ),tNGS的測序數據(jù)量(liáng)更少(shǎo),因此成本更(gēng)低。
三(sān),tNGS缺點(diǎn)
1. 漏檢非(fēi)靶(bǎ)向基因(yīn):tNGS技(jì)術(shù)隻(zhī)能檢(jiǎn)測預(yù)設(shè)的目標(biāo)序列(liè),無(wú)法檢(jiǎn)測非(fēi)預設的(dí)病(bìng)原(yuán)體(tǐ)。
2. 文庫(kù)製備復雜(zá):文(wén)庫製備過程(chéng)需(xū)要(yào)更(gēng)多的(dí)時(shí)間(jiān)和(hé)試(shì)劑(jì),且操(cāo)作較為(wéi)復雜(zá)。
四,tNGS應用場景(jǐng)
1. 感(gǎn)染(rǎn)性疾病診斷:tNGS技術能(néng)夠(gòu)快(kuài)速,準(zhǔn)確地(dì)檢(jiǎn)測臨床(chuáng)樣本(běn)中的多種(zhǒng)病(bìng)原(yuán)微(wēi)生物,特(tè)別(bié)是(shì)對低(dī)濃(nóng)度的病(bìng)原微(wēi)生物(wù)及(jí)其(qí)毒力(lì)和(hé)耐藥(yào)基(jī)因的(dí)檢(jiǎn)測具有(yǒu)顯(xiǎn)著優(yōu)勢。這(zhè)種方法不(bù)依賴於傳統的微(wēi)生物培(péi)養,直接對(duì)樣本(běn)中的(dí)幾十種(zhǒng)至幾(jī)百種已知(zhī)病(bìng)原(yuán)微(wēi)生(shēng)物及其(qí)毒力(lì)和/或(huò)耐藥基(jī)因(yīn)進(jìn)行(háng)富(fù)集,再(zài)進(jìn)行高(gāo)通量(liáng)測(cè)序,然後與數據(jù)庫進行比(bǐ)對(duì)分析(xī),從而提(tí)供客觀(guān)的診斷(duàn)依(yī)據。
2. 耐(nài)藥結(jié)核(hé)病檢(jiǎn)測:tNGS技術在(zài)耐(nài)藥結(jié)核病(bìng)檢測中表現(xiàn)出色(sè)。世界(jiè)衛生(shēng)組(zǔ)織(WHO)發(fā)布的(dí)報告指出,tNGS技術能(néng)夠(gòu)有效檢測(cè)結核分枝杆(gān)菌(jūn)的耐(nài)藥(yào)性,具有較(jiào)高(gāo)的(dí)診斷準(zhǔn)確(què)性和(hé)成(chéng)本效(xiào)益。盡(jìn)管傳統分(fēn)子(zǐ)診(zhěn)斷技術已廣泛應用(yòng),但tNGS技術(shù)提(tí)供(gōng)了(liǎo)更(gēng)全麵(miàn)的(dí)檢測(cè)範圍,解(jiě)決了(liǎo)部分(fēn)藥物檢(jiǎn)測的盲(máng)區,特(tè)別(bié)是在多耐(nài)藥結(jié)核(hé)病的判(pàn)定(dìng)上(shàng)具有顯著優勢。
3.呼(hū)吸(xī)道病原(yuán)體檢測:tNGS技術也被應用於(yú)呼吸道病原(yuán)體的(dí)檢測(cè)。例(lì)如,精(jīng)準(zhǔn)分(fēn)子醫學中(zhōng)心開展(zhǎn)的呼吸道病(bìng)原(yuán)體靶(bǎ)向(xiàng)測序(tNGS)檢(jiǎn)測(cè)項目,能夠覆蓋常見(jiàn)的(dí)呼吸道病原(yuán)微(wēi)生物,包(bāo)括細(xì)菌,病(bìng)毒,真(zhēn)菌(jūn)等,輔(fǔ)助指(zhǐ)導(dǎo)臨床用藥。該技術不(bù)僅(jǐn)提高(gāo)了(liǎo)診(zhěn)斷(duàn)的準確性,還提供了耐(nài)藥基因的(dí)檢測(cè)報(bào)告(gào),有(yǒu)助於(yú)精準治療。
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