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更新時間:2023-11-29
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瓊脂(zhī)糖凝膠(jiāo)電泳是根(gēn)據(jù)核酸(DNA或(huò)RNA)分(fēn)子(zǐ)大(dà)小(xiǎo)來分離和識別(bié)物(wù)質的技(jì)術。那(nà)麼(mó)你知道瓊(qióng)脂糖(táng)凝膠(jiāo)電泳的(dí)常見問題有(yǒu)哪些嗎?讓(ràng)我們一(yī)起來(lái)看看吧(bā)!
一(yī),同樣(yàng)大小的DNA一(yī)起跑(pǎo)電(diàn)泳(yǒng)條帶不(bù)一樣大
DNA條(tiáo)帶不一(yī)樣大,本質上是DNA在(zài)凝(níng)膠中(zhōng)的(dí)遷移(yí)率(shuài)不一樣(yàng),有(yǒu)的跑(pǎo)得快,有的慢,通常(cháng)情況同(tóng)樣大小的DNA,遷移率是一樣的,條(tiáo)帶位置(zhì)也會(huì)一(yī)樣(yàng)。
但遷(qiān)移率也受很多因素影響,例如(rú)DNA的構象。例如(rú)環(huán)狀超螺旋結(jié)構的(dí)DNA,和(hé)同等(děng)大(dà)小的綫性DNA(例如單位(wèi)點酶切後的質粒(lì)),前者的遷移(yí)率要高(gāo),表現出來就是(shì)看上(shàng)去(qù)超螺旋(xuán)結構(gòu)的DNA分子量好像(xiàng)小(xiǎo)一點(diǎn)。
二(èr),加大(dà)電泳的(dí)電(diàn)壓,DNA會跑得(dé)快(kuài),但有時(shí)效(xiào)果卻不明(míng)顯
在較(jiào)低(dī)電壓時(shí),提高電(diàn)壓(yā),DNA的(dí)遷(qiān)移率也會提(tí)高;但如果DNA分(fēn)子量太(tài)大時,增(zēng)加電壓(yā)後對DNA遷移(yí)率的提高(gāo)其(qí)實不(bù)成比例(lì),說(shuō)白(bái)一(yī)點(diǎn),就(jiù)是有(yǒu)效(xiào)果,但不(bù)明顯(xiǎn)。
例(lì)如,當(dāng)DNA分子量(liáng)大於(yú)2Kb後(hòu),施加在(zài)電泳槽(cáo)兩(liǎng)端(duān)的電壓(yā)不(bù)應(yīng)該(gāi)高(gāo)於5V/cm,如(rú)果(guǒ)電泳槽長40cm,那麼電(diàn)壓(yā)不(bù)應(yīng)該(gāi)高於200V。
三(sān),瓊脂(zhī)糖質(zhì)量(liáng)對(duì)電泳效(xiào)果有(yǒu)多(duō)大(dà)影(yǐng)響(xiǎng)
有(yǒu)時候(hòu),換了(liǎo)一(yī)個(gè)批次(cì)的(dí)瓊(qióng)脂糖(táng),或者(zhě)更換了(liǎo)新(xīn)的供應(yīng)商的瓊(qióng)脂糖後,同(tóng)樣的樣品(pǐn)進行(háng)電泳,效(xiào)果也(yě)會(huì)有差異。
最(zuì)常見(jiàn)的一(yī)個原因在於,瓊脂(zhī)糖本(běn)身的(dí)質(zhì)量也是影響電(diàn)泳(yǒng)結(jié)果(guǒ)的一(yī)個因(yīn)素。
瓊脂(zhī)糖(táng)由(yóu)大(dà)量(liáng)的多(duō)糖(táng)組(zǔ)成,這些多糖會與硫酸鹽吸附,成為一種(zhǒng)叫(jiào)硫酸化(huà)多糖的(dí)東西。在電泳時(shí),它會(huì)產生正電(diàn)荷,並向陰極(jí)移動,也(yě)就是和DNA移動的(dí)方(fāng)向相反。
四(sì),電(diàn)泳緩(huǎn)衝(chōng)液(yè)對電(diàn)泳效(xiào)果(guǒ)有多大影響
電泳(yǒng)時,電(diàn)泳(yǒng)緩衝(chōng)液(yè)是一種經(jīng)常(cháng)需要(yào)更(gēng)換(huàn)的(dí)試(shì)劑。
最li想的(dí)狀態(tài),應(yīng)該(gāi)是(shì),使用(yòng)同一批(pī)次(cì)的(dí)電泳(yǒng)緩(huǎn)衝液母液(yè)進行(háng)1X電泳緩(huǎn)衝(chōng)液的配置(zhì)和對(duì)應檔次電(diàn)泳的凝膠配置。因為隻(zhī)有這(zhè)樣(yàng)操作(zuò),才能保證整個(gè)離(lí)子(zǐ)緩衝(chōng)環境(jìng)是一(yī)致(zhì)的(dí)。
另(lìng)外,常(cháng)見(jiàn)的電泳緩(huǎn)衝液的使(shǐ)用(yòng)錯誤,還(huán)包括,直接倒(dǎo)入自來水替代電(diàn)泳(yǒng)緩衝液(yè),或者(zhě)直接使(shǐ)用10X或(huò)50X的母液(yè)當(dāng)緩(huǎn)衝液進行電泳。‘
前者因為緩(huǎn)衝(chōng)體係內缺(quē)乏足(zú)夠的離子,造(zào)成電導率(shuài)很(hěn)低(dī),DNA遷移速(sù)度很(hěn)慢,甚至wan全不(bù)動了;而(ér)後者(zhě)則因為電導率太(tài)高,造(zào)成整(zhěng)個緩(huǎn)衝液(yè)產熱太(tài)厲害(hài),甚至連凝(níng)膠都融化(huà)了(liǎo)。
更(gēng)多(duō)有(yǒu)關(guān)瓊(qióng)脂(zhī)糖凝(níng)膠電(diàn)泳(yǒng)的(dí)常見問(wèn)題(tí),請聯係天津(jīn)益(yì)元利康(kāng)生(shēng)物科(kē)技有(yǒu)限公司(sī)。
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